การป้องกันโรคติดต่อทางอาหาร และน้ำ ต้องเน้นการรักษาความสะอาดและความปลอดภัยในอาหารและน้ำที่บริโภค รวมถึงปฏิบัติตามสุขอนามัยส่วนบุคคล วิธีป้องกันที่มีประสิทธิภาพจะเกี่ยวข้องกับการลดความเสี่ยงของการติดเชื้อจากแบคทีเรีย ไวรัส หรือปรสิตในอาหารและน้ำ สามารถทำได้ดังนี้

1. ทานอาหารที่ปรุงสุกใหม่

2. อาหารที่เกิน 2 ชั่วโมง ควรนำมาอุ่นก่อนทาน

3. เลือกอาหาร น้ำดื่ม น้ำแข็งที่สะอาด และล้างมือก่อนทานอาหารทุกครั้ง